طي يك تحقيق جامع كه طي سال‌هاي 1395 الي 1397 در سراسر كشور انجام گرفت، وضعيت ويروس‌هاي در گردش در كشور شناسايي شده و مشخص گرديد ويروس‌هاي در گردش هم از نظر ژنتيكي و هم از نظر آنتي‌ژني با سويه واكسن متفاوت هستند. ماحصل اين بررسي شناسايي و انتخاب يك ويروس آنفلوانزاي پرندگان تحت‌تيپ H9N2 به عنوان سويه غالب در گردش و مناسب جهت استفاده به‌عنوان بذر واكسن در واكسن‌هاي غيرفعال تك ظرفيتي و چند ظرفيتي و تهيه آنتي‌ژن‌هاي استاندارد براي انجام تست ممانعت‌كننده از هماگلوتيناسيون (HI) در آزمايشگاه‌هاي دامپزشكي كشور.بود. واكسيناسيون طيور به عنوان گزينه‌اي در جهت كمك به كنترل آنفلوانزاي پرندگان پذيرفته شده است. تاكنون، توليد واكسن‌هاي طيور براساس انتخاب سويه‌هاي واكسن آنفلوانزاي پرندگان برمبناي تحت‌تيپ‌هاي همولوگ HA بوده است، زيرا واكسن‌هاي برپايۀ يك سويۀ واكسن خاص، فراهم كنندۀ ايمني محافظتي عليه تقريباً تمام ويروس‌هاي تحت‌تيپ HA يكسان مي باشند. واكسيناسيون در برابر ويروس همولوگ در ابتدا نسبتاً مؤثر واقع مي‌شود، اما با گذشت زمان احتمالاً بدليل ظهور واريانت‌هاي ويروسي ناشي از دريفت آنتي‌ژني ويروس‌هاي اوليه حفاظت كاملي را فراهم نمي‌كنند. در ايران واكسن‌هاي كشته از سويه‌هاي اوليه H9N2 مشتق شده اند و به طور گسترده در مزارع طيور به منظور كاهش اثرات H9N2 مورد استفاده قرار مي‌گيرند. اين فشار ايمني ناشي از واكسيناسيون سبب القاي موتاسيون در ژن‌هاي ايمونوژن سطحي HA و NA مي‌گردد. درنتيجه، بروز اين بيماري علي‌رغم واكسيناسيون گهگاهي در طيور واكسينه شده ديده مي شود. در ايران نيز سويۀ مورد استفاده در واكسيناسيون با استفاده از سويۀ پروتوتيپ H9N2 ايران از اواخر دهۀ 1990 پس از اولين شيوع ويروسي H9N2 برگزيده شده است. بنابراين، همانند آنفلوآنزاي انساني كه بذر واكسن به‌طور ساليانه مورد بررسي ژنتيكي و آنتي‌ژني قرار مي‌گيرد، سويه‌هاي واكسن آنفلوانزاي طيور نيز مي بايست از لحاظ آنتي ژني و ژنتيكي مورد ارزيابي قرار گيرد تا ويروس به‌مراتب نزديك به سويه واكسن انتخاب گردد. ارزيابي توالي ژن HA و خصوصيت آنتي‌ژني ويروس هاي آنفلوانزا از عوامل مهم در انتخاب سويۀ واكسن مي باشد. در اين بررسي چهار دليل عمده جهت استفاده از اين سويه در توليد واكسن وجود دارد: 1) وجود همولوژي 89% در ژن HA بين سويۀ قديم واكسن و سويه اخير و